Detalles de la búsqueda
1.
Machine learning approach identifies prominent codons from different degenerate groups influencing gene expression in bacteria.
Genes Cells
; 27(10): 591-601, 2022 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35996802
2.
Stem Region of tRNA Genes Favors Transition Substitution Towards Keto Bases in Bacteria.
J Mol Evol
; 90(1): 114-123, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35084523
3.
Codon degeneracy and amino acid abundance influence the measures of codon usage bias: improved Nc (NÌc ) and ENCprime (NÌ'c ) measures.
Genes Cells
; 22(3): 277-283, 2017 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28185367
4.
Essential role of the ESX-3 associated eccD3 locus in maintaining the cell wall integrity of Mycobacterium smegmatis.
Int J Med Microbiol
; 308(7): 784-795, 2018 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30257807
5.
Disruption of comA homolog in Ralstonia solanacearum does not impair its twitching motility.
J Basic Microbiol
; 57(3): 218-227, 2017 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28083961
6.
Selection on GGU and CGU codons in the high expression genes in bacteria.
J Mol Evol
; 78(1): 13-23, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24271854
7.
gltB/D mutants of Xanthomonas oryzae pv. oryzae are virulence deficient.
Curr Microbiol
; 68(1): 105-12, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23995777
8.
Combined In Silico and In Vitro Study to Reveal the Structural Insights and Nucleotide-Binding Ability of the Transcriptional Regulator PehR from the Phytopathogen Ralstonia solanacearum.
ACS Omega
; 8(38): 34499-34515, 2023 Sep 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37779998
9.
Microliter spotting and micro-colony observation: A rapid and simple approach for counting bacterial colony forming units.
J Microbiol Methods
; 207: 106707, 2023 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36931327
10.
Transfer RNA gene numbers may not be completely responsible for the codon usage bias in asparagine, isoleucine, phenylalanine, and tyrosine in the high expression genes in bacteria.
J Mol Evol
; 75(1-2): 34-42, 2012 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23053196
11.
Glycome Profiling and Bioprospecting Potential of the Himalayan Buddhist Handmade Paper of Tawang Region of Arunachal Pradesh.
Front Plant Sci
; 13: 831589, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35677250
12.
Incorporation of transition to transversion ratio and nonsense mutations, improves the estimation of the number of synonymous and non-synonymous sites in codons.
DNA Res
; 29(4)2022 Jun 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35920776
13.
Structural insight into locked nucleic acid based novel antisense modifications: A DFT calculations at monomer and MD simulations at oligomer level.
J Mol Graph Model
; 107: 107945, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34102527
14.
Immunoinformatics mapping of potential epitopes in SARS-CoV-2 structural proteins.
PLoS One
; 16(11): e0258645, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34780495
15.
The Entner-Doudoroff and Nonoxidative Pentose Phosphate Pathways Bypass Glycolysis and the Oxidative Pentose Phosphate Pathway in Ralstonia solanacearum.
mSystems
; 5(2)2020 Mar 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32156794
16.
An Innovative Approach to Study Ralstonia solanacearum Pathogenicity in 6 to 7 Days Old Tomato Seedlings by Root Dip Inoculation.
Bio Protoc
; 8(21): e3065, 2018 Nov 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34532529
17.
Discrepancy among the synonymous codons with respect to their selection as optimal codon in bacteria.
DNA Res
; 23(5): 441-449, 2016 Oct 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27426467
18.
Comparative analysis of codon usage bias in Crenarchaea and Euryarchaea genome reveals differential preference of synonymous codons to encode highly expressed ribosomal and RNA polymerase proteins.
J Genet
; 95(3): 537-49, 2016 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27659324
19.
Constraint on di-nucleotides by codon usage bias in bacterial genomes.
Gene
; 536(1): 18-28, 2014 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24333347
20.
Differentiation of petroleum hydrocarbon-degrading Pseudomonas spp. based on PCR-RFLP of the 16S-23S rDNA intergenic spacer region.
Folia Microbiol (Praha)
; 57(1): 47-52, 2012 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22193887